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持続感染とヒトの遺伝的変異の複合的な C への影響

Nov 25, 2023

BMC Medicine volume 20、記事番号: 416 (2022) この記事を引用

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7 オルトメトリック

メトリクスの詳細

複数のヒト病原体が慢性的な感染症を引き起こし、場合によっては生涯にわたる感染症を引き起こします。 たとえ潜伏性であることが多いとしても、これらの感染症はある程度の局所的または全身的な免疫反応を引き起こし、慢性的な軽度の炎症を引き起こす可能性があります。 持続性感染症とヒトの遺伝的変異の両方が慢性的な軽度の炎症に寄与する可能性については、依然として不完全な理解が残っています。 私たちは、UK Biobank と CoLaus|PsyCoLaus Study という 2 つの大規模な集団ベースのコホートに関連して収集されたデータを使用して、13 種類の持続性病原体に対する血清陽性と炎症性バイオマーカー C 反応性タンパク質 (CRP) の血漿レベルとの間の潜在的な関連性を探索しました。 。 我々は、各病原体の血清状態、CRP の多遺伝子性リスクスコア、CRP に関連することが知られている人口統計学的および臨床的要因という潜在的な予測因子から始めて逆方向段階的回帰を実行しました。 我々は、クラミジア・トラコマティス(P 値 = 5.04e − 3)およびヘリコバクター・ピロリ(P 値 = 8.63e − 4)の血清陽性と高い血漿 CRP レベルとの間に関連性があるという証拠を発見した。 また、病原体負荷と CRP レベルとの間に関連性があることも発見しました (P 値 = 4.12e − 4)。 これらの結果は、ヒトの長期罹患率の重要な決定要因である持続感染と慢性炎症との関係についての理解を深めます。

査読レポート

炎症は、組織損傷、感染、毒素への曝露などの有害な刺激に対する免疫系の複雑かつ必要な反応です [1]。 血流の変化と血管透過性の増加を特徴とする急性期には、血漿タンパク質と白血球が循環から炎症部位に移動します[2]。 通常、この即座の防御反応により、細胞損傷の最初の原因が排除され、恒常性が回復します。 ただし、刺激への長時間の曝露などにより、急性反応が組織損傷を除去できない場合、炎症が慢性プロセスになる可能性があります[3]。 冠動脈疾患、2 型糖尿病、一部の癌など、多くの一般的な病気は少なくとも部分的には慢性炎症によって引き起こされます [4]。 したがって、炎症は攻撃に対する人間の防御において重要な役割を果たしていますが、公衆衛生上重要な複数の病気の病態生理学にも寄与しています。

Diagnostic tests are capable of detecting the presence and intensity of systemic inflammation [5]. The most commonly used inflammatory biomarker is the acute-phase reactant C-reactive protein (CRP). This ring-shaped protein is produced by hepatocytes upon stimulation by pro-inflammatory cytokines such as interleukin (IL)-1b, IL-6, and TNF-a. Although CRP is commonly used as a sensitive indicator of inflammation, the factors influencing its baseline plasma levels are only partially understood. Circulating amounts of CRP are positively associated with age, body mass index (BMI), and smoking and inversely with male sex and physical activity [6,7,8]. In addition, large-scale genomic analyses have found multiple associations with hs-CRP levels, mainly in the loci enriched in hepatic, immune, and metabolic pathways, such as CRP, LEPR, IL6R, GCKR, APOE, and HNF1A-AS1 [ 80 000 subjects identifies multiple loci for C-reactive protein levels. Circulation. 2011;123(7):731–8." href="#ref-CR9" id="ref-link-section-d10595495e546">9, 200,000 individuals identify 58 loci for chronic inflammation and highlight pathways that link inflammation and complex disorders. Am J Human Genet. 2018;103(5):691–706." href="#ref-CR10" id="ref-link-section-d10595495e546_1"> 10、11、12、13、14]。 全体として、遺伝的変異は血漿 CRP レベルの変動の最大 16% を説明します [14]。

We carried out a polygenic risk score (PRS) analysis to investigate the relationship between human genetic variation and hs-CRP levels. A CRP-PRS was calculated for each study participant based on the risk effects of common SNPs derived from GWAS summary statistics of hs-CRP. As a baseline cohort, we referred to the GWAS summary statistics of the CHARGE cohort (N = 204,402, heritability h2 = 6.5%) [ 200,000 individuals identify 58 loci for chronic inflammation and highlight pathways that link inflammation and complex disorders. Am J Human Genet. 2018;103(5):691–706." href="/articles/10.1186/s12916-022-02607-7#ref-CR10" id="ref-link-section-d10595495e675"10, 27]. These summary statistics were used to construct the CRP-PRS in our target cohort consisting of the merged UK Biobank and CoLaus|PsyCoLaus data using the clumping and thresholding method of the PRSice-2 v2.2.7 software [28]. We used a standardized method to obtain PRS, by multiplying the dosage of risk alleles for each variant by the effect size in the GWAS and summing the scores across all of the selected variants. SNPs were clumped based on linkage disequilibrium (LD) (r2 ≥ 0.1) within a 250-kb window. Model estimates of the PRS effect were adjusted for sex, age, BMI, and the top 10 PCs. As an additional quality control, the distribution of PRS was checked in each cohort separately, to ensure that they followed a normal distribution./p>

We first investigated the relationship between common genetic variation and hs-CRP levels by calculating a PRS for all study participants. The PRS explained about 4% of the variation in hs-CRP levels, in agreement with previously published results [ 80 000 subjects identifies multiple loci for C-reactive protein levels. Circulation. 2011;123(7):731–8." href="/articles/10.1186/s12916-022-02607-7#ref-CR9" id="ref-link-section-d10595495e1261"9]. We also found that BMI was the major non-genetic predictor of hs-CRP, with approximately 19% of the variance explained./p> 80 000 subjects identifies multiple loci for C-reactive protein levels. Circulation. 2011;123(7):731–8./p> 200,000 individuals identify 58 loci for chronic inflammation and highlight pathways that link inflammation and complex disorders. Am J Human Genet. 2018;103(5):691–706./p>